El Museo Arqueológico de Almería con sólo dos años de vida, recibió la mención de honor de la EMF (Foro Europeo de los Museos). Ésta organización sin ánimo de lucro y respaldada por el Consejo de Europa y presidida por la reina Fabiola de Bélgica también ha concedido otras dos menciones de honor y el premio al mejor museo europeo del año. El premio a mejor museo europeo se le ha concedido a Tallin (Estonia). La convocatoria correspondiente al año 2007 se celebró el pasado viernes 16 de mayo en Dublín, a la que acudieron aspirantes para distintas modalidades.
El reconocimiento pertenece a la categoría de museos arqueológicos, en la que también participaron el Museo Arqueológico y de Historia de Elche y el Museo de Gavá. Antes de llegar a la fase final y recibir la distinción logró la condición de aspirante tras el informe que presentaron, después de su visita a Almería y el recorrido tanto por el propio Museo como por algunos de los yacimientos arqueológicos que constituyen su base, Virgil Stefan Nitulesco, ministro de Cultura de Rumanía, y Thomas Brune, etnólogo alemán y comisario del Würtember State Museum de Stuttgart.